中國古玩研究院是商會所屬的學術性研究與學術性培訓機構，主要功能是為會員提供四項服務：一是課題研究服務，全面提高會員的專業研究水平。二是專業培訓服務，全面提高會員的專業知識水平。三是資質認證服務，為達到相應的資質水平但無法獲得相應資質的會員評定資質。四是研究成果推廣服務，為會員的研究成果進行宣傳和推廣。
研究院目前已經設立的內部機構包括：學術委員會、職稱評定委員會、教務委員會、專業技術培訓中心、研究成果推廣中心、學術著作出版中心等。
研究院試驗階段陸續推出了院士聘請制度、研究員聘請制度、教授聘請制度、研究所設置制度。已經聘請了4名院士和29名研究員。已經成立了一個研究所。
根據商會制定的《鳳凰2015培訓規劃》，研究院近期將推出兩類項目：第一類是系列培訓，如：會長高級研修班，專題進修班，藝術品鑒定師、藝術品評估師職稱培訓班等。第二類是出版中國古玩研究院叢書，如：中國民間文物檔案、中國民間文物白皮書、古玩商會會長論文集、研究會論文集、《大師》專刊、《云工獎》獲獎作品集等。
即將出版的研究院院刊將定名為《紫御主人》。
研究院院長是宋建文，研究院副院長是鄔烈中、劉心亮、劉亞諫。